2004-й для таможенных органов Приднестровья стал годом реформирования. 12 марта Указом Президента ПМР ГТК был реорганизован. Произошли изменения в структуре его управления. Теперь она выглядит следующим образом:

– управление организации таможенных режимов, контроля и внешнеэкономических связей; – управление по борьбе с контрабандой и нарушениями таможенных правил; – правовой отдел; – финансово-экономическое управление; – отдел кадров; – управление информации и технического обслуживания; – секретариат; – оперативно-дежурная служба; – управление собственной безопасности; – управление материально-технического снабжения; – отдел по международному сотрудничеству и связям со СМИ.

Благодаря проведенному комплексу реорганизационных мероприятий, удалось значительно повысить эффективность работы всех подразделений, в том числе и таможен.

Кроме того, 2004-й вошел в историю ГТК ПМР как год формирования новых структур, в т.ч. связанных с околотаможенной сферой. Внутриведомственным Приказом от 15 сентября утверждено «Положение об Энергетической таможне ГТК ПМР». Она вошла в структуру таможенных органов Приднестровья. А главной целью создания подразделения явилось совершенствование контроля над энергоносителями, перемещаемыми через таможенную территорию ПМР различными видами транспорта (трубопроводным, автомобильным, железнодорожным, по линиям электропередач и др.). Энерготаможня выполняет в подконтрольной сфере свою главную задачу – способствует наиболее эффективному осуществлению таможенной политики ПМР. Ее деятельность направлена на обеспечение энергетической безопасности республики.

20 сентября этого же года Государственным таможенным комитетом учреждено государственное унитарное предприятие «Таможенный брокер». Оно было создано в целях удовлетворения общественных потребностей, возникающих при таможенном оформлении товаров и транспортных средств. Основными видами деятельности ГУП стали: осуществление операций по таможенному оформлению, оценка товаров и транспортных средств, проведение товароведческих экспертиз, выполнение других посреднических функций в области таможенного дела. С годами перечень видов деятельности «Таможенного брокера» был значительно расширен.

В канун 12-й годовщины организации таможенных органов ПМР на ТПП «Первомайск» Тираспольской таможни был открыт новый современный грузовой таможенный терминал. Этот пункт пропуска имеет статус международного. Введение в эксплуатацию грузового терминала позволило значительно разгрузить в зоне таможенного контроля полосы для прохождения пассажирского транспорта, содействовало совершенствованию процедуры таможенного контроля и созданию условий для более быстрого его прохождения гражданами, перемещающимися через таможенную границу ПМР. Наличие надежной, современной телефонной и компьютерной связи явилось непременным условием для эффективной работы терминала. В его помещении установлена офисная АТС для организации телефонной связи внутри терминала, а общение с Тираспольской таможней и с административным корпусом ГТК осуществляется благодаря линиям компьютерной связи и IP-телефонии.

Согласно Приказу ГТК ПМР от 16 января 2004 года «Об организации учебного процесса по изучению английского языка», при таможенном комитете начинают функционировать специальные курсы, деятельность которых направлена на улучшение профессиональной подготовки приднестровских таможенников, а также на повышение авторитета таможенных органов ПМР, что особенно важно в условиях постоянно увеличивающегося потока иностранных граждан через таможенную границу республики.

В этом же году таможенный комитет приступил к созданию ведомственного стрелкового тира. Пустующее здание на баланс ГТК ПМР передал Тираспольский завод литейных машин им. С.М. Кирова. Цель организации собственного тира – повышение боевого мастерства приднестровских таможенников.

23 августа 2004 года – дата основания общественной организации «Общество физической культуры и спорта таможенных органов Приднестровской Молдавской Республики “Меркурий”». Среди основных задач «Меркурия» – привлечение к регулярным занятиям спортом всех его членов, организация, обеспечение и проведение физкультурно-массовых мероприятий, содействие в развитии военно-служебных и прикладных видов спорта, охрана здоровья, укрепление межнациональных и международных связей в области спорта и т.д. «Меркурий» стал вторым в Приднестровье спортивным обществом правоохранительных органов Приднестровья такого уровня.