Кабинет министров Украины постановлением № 852 от 24 сентября 2008 года по предложению Государственной таможенной службы образовал на базе Киевского центра повышения квалификации и переподготовки кадров Гостаможслужбы Государственный научно-исследовательский институт таможенного дела.

 Государственный научно-исследовательский институт таможенного дела отнесен к сфере управления Гостаможслужбы. Согласно постановлению правительства, Государственная таможенная служба в двухмесячный срок должна утвердить устав, структуру и штатное расписание института и осуществить другие мероприятия по его материально-техническому и кадровому обеспечению.